Первые письменные упоминания о поселениях людей на территории современного Силламяэ относится к 1502 году, когда в летописи упоминается придорожная корчма Tor Вruggen. Эти земли, в силу своего географического положения, неоднократно были причиной войн между государствами. Во время Северной войны (1700-1721гг) Россия отвоевала у Швеции эти земли. До сих пор восточнее Силламяэ можно увидеть укрепления тех времен - "Шведский вал".
В 1700 году здесь были построены мост через реку и мельница. Некоторое время земли входили в состав поместья Вайвара, из которого впоследствии выделилось полупоместье Силламяги.

В конце 19-го века в связи с православизацией Эстонии в Силламяэ строится православная церковь «Иконы Казанской Божьей Матери». Архитектор А.К. Монтаг. В этот период Силламяэ становится одним из любимых мест отдыха петербургской и московской интеллигенции.

http://www.sillamae-muuseum.ee/